邵婷婷,博士研究生,副教授。
办公地址:分子生物211
E-mail:shaotingting@eustarcert.com
主要研究方向
生物信息学;计算表观遗传学
个 人 简 介
邵婷婷,博士,副教授,博士研究生导师, 星联教师。2015年毕业于哈尔滨医科大学获生物医学工程博士学位,同年至哈尔滨医科大学生物信息学教研室工作,研究方向为生物信息学,主要研究肿瘤免疫、微生物组信息学、复杂疾病相关非编码RNA标记的识别及功能分析。主讲课程包括《美高梅博彩网站》、《美高梅》、《美高梅》《美高梅》《美高梅博彩网站》《美高梅博彩网站》等。先后主持国家及省级项目共计7项,包括国家自然科学基金2项,黑龙江省自然科学基金1项,中国博士后基金1项,黑龙江省博士后基金1项,黑龙江省博士后启动金1项,校创新基金1项,同时作为研究骨干参与多项国家级重点项目,近年来以第一作者及通讯作者在《美高梅博彩网站》、《美高梅博彩网站》及《美高梅》等杂志发表多篇SCI论文,参与编写springer出版社《美高梅》(the third edition)等2部外文论著,担任Scientific Reports、BMC genomics及Egyptian Journal of Medical Human Genetics等杂志审稿人。同时主持省教学改革教学课题一项,并发表多篇教学论文,先后指导省级校级大学生创新创业项目,指导大学生建模竞赛获得亚太国际建模比赛国际三等奖,大学生数学建模竞赛国家级二等奖等,省级一等奖等多个奖项。
教育经历:
2013.09-2017.07哈尔滨工业大学 生物医学工程专业 博士
2010.09-2013.07哈尔滨医科大学 生物医学工程专业 硕士
2005.09-2010.07哈尔滨医科大学 生物技术专业(生物信息学方向)学士
工作经历:
2020.09-至今,哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院,副教授
2017.09-2020.09,哈尔滨医科大学,生物信息科学与技术学院,讲师
教学项目(仅列省部级):
1)黑龙江省高等教育教学改革研究一般研究项目:基于智慧教学+CDIO理念的大学生数学建模培训实践与研究,2019年,黑龙江省教育厅,主持,在研。
2)黑龙江省高教学会“十三五”规划课题:多学科交叉融合的生物信息学本科专业创新教学体系研究与实践,2018年,黑龙江省教育厅,参与,已结题;
主持科研项目
1) 国家自然科学基金面上项目:肿瘤免疫微环境中非编码RNA协同调控网络构建及调控机制研究(62073106), 2021年-2024年,在研;
2) 黑龙江省国家自然科学基金联合引导项目:肿瘤免疫微环境中ncRNA共调控识别及其机制研究(LH2020C055),2020年-2023年,在研;
3) 黑龙江省博士后启动金:泛癌非编码RNA免疫协同调控网络构建及其临床应用研究(LBH-Q20153),2021年-2023年,在研;
4) 国家自然科学基金青年项目:基于多组学数据融合的泛癌中非编码RNA crosstalk模式研究(31601065),2017年-2019年,结题;
5) 中国博士后第61批面上项目:癌症中ncRNA交互作用系统识别及其功能特征研究(2017M611385),2017年-2019年,结题;
6) 黑龙江省博士后基金项目:非编码RNA(miRNA/lncRNA)协同调控网络重构揭示癌症发生的共性及异质性研究(LBH-Z16152),2016年-2018年,结题;
7) 哈尔滨医科大学创新基金项目:基于ncRNA交互网络重构的癌症相关ncRNA优化及调控机制研究(2016JCZX45),2016年-2018年,结题
教学成果奖励:
1) 黑龙江省教学成果二等奖:“科教融合、全程多元、知行合一”的生物信息学专业创新教学体系研究与实践,美高梅,排名第四;
2) 哈尔滨医科大学教学成果一等奖:“科教融合、全程多元、知行合一”的生物信息学专业创新教学体系研究与实践,美高梅,排名第四;
3) 哈尔滨医科大学教学成果二等奖:生物信息学专业教育混合创新教学模式的研究,2020,排名第二。
指导学生获奖及创新创业项目:
1)国际三等奖(指导教师),2021年,亚太国际建模比赛
2) 国家二等奖(指导教师),2020年,中国数学建模竞赛;
3) 省一等奖(指导教师),2020年,中国数学建模竞赛
4) 省一等奖(指导教师),2019年,中国数学建模竞赛
5) 省一等奖(指导教师),2020年,东三省数学建模竞赛
6) 省一等奖(指导教师),2019年,东三省数学建模竞赛;
7) 省三等奖(指导教师),2019年,东三省数学建模竞赛;
8) 黑龙江省创新创业项目(指导教师),2016年,黑龙江省教育厅;
9) 哈尔滨医科大学优秀本科生论文指导教师, 2021年,哈尔滨医科大学;
参编写的著作:
1)《美高梅》,2019年,Elsevier出版社,编委;
2)《美高梅》(the third edition),2017年,springer出版社,编委;
发表SCI论文
1) Tingting Shao, Zheng Zhao, Aiwei Wu, Jing Bai, Yongsheng Li, Hong Chen, Chunjie Jiang, Yuan Wang, Shengli Li, Letian Wang, Fengmin Zhang*, Juan Xu* , Xia Li*.Functional dissection of virus-human crosstalk mediated by miRNAs based on the VmiReg database [J]. Molecular Biosystems, 2015.
2) Tingting Shao, Aiwei Wu , Juan Chen , Hong Chen , Jianping Lu , Jing Bai , Yongsheng Li*, Juan Xu*, Xia Li*.Identification of module biomarkers from the dysregulated ceRNA-ceRNA interaction network in lung adenocarcinoma [J]. Molecular Biosystems, 2015.
3) Yongsheng Li§, Tingting Shao§, Chunjie Jiang§, Jing Bai, Zishan Wang, Jinwen Zhang, Lili Zhang, Zheng Zhao, Juan Xu* & Xia Li* .Construction and analysis of dynamic transcription factor regulatory networks in the progression of glioma[J].Scientific Reports, 2015, 5: 15953-15953.(SCI:4.996)
4) Tingting Shao*, Guangjuan Wang*, Hong Chen*, Yunjin Xie*, Xiyun Jin, Jing Bai, Juan Xu, Xia Li, Jian Huang, Yan Jin and Yongsheng Li, Survey of miRNA-miRNA cooperative regulation principles across cancer types, Briefings in Bioinformatics, 2018.(SCI:13.994)
5) Hong Chen1,#, Jun Xiao1,#,Tingting Shao1,#, Li Wang1,#, Jing Bai1, Xiaoyu Lin1, Na Ding1, Yinwei Qu1, Yi Tian1, Xiang Chen1, Hui Liu1,*, Hongyu Liu3,*, Juan Xu1,2,* and Xia Li1,2,* Landscape of enhancer-enhancer cooperative regulation during human cardiac commitment Molecular Therapy - Nucleic Acids;2019.7.(SCI: 10.183)
6) Xu Juan#*;Shao Tingting#; Song Mingxu#; Xie Yunjin; Zhou Jialiang; Yin Jiaqi; Ding Na; Zou Haozhe; Li Yongsheng*; Zhang Jiwei*; MIR22HG acts as a tumor suppressor via TGFβ/SMAD signaling and facilitates immunotherapy in colorectal cancer, Molecular Cancer, 2020, 19(51 (2020)).(SCI:41.444)
7) Lv D, Xu K, Yang C, Liu Y, Luo Y, Zhou W, Zou H, Cai Y, Ding N, Li X*,Shao T*, Li Y*, Xu J*. Pres: A Webserver for Decoding the Functional Perturbations of Rna Editing Sites. Briefings in bioinformatics. 美高梅;23(4). (SCI: 13.994)
8) Liu H, Jiang T, Wang S, Chen X, Jin X, Wang Q, Li X, Yin J,Shao T*, Li Y*, Xu J* and Wu Q*. A Novel Approach to Identify Enhancer lincRNAs by Integrating Genome, Epigenome, and Regulatome. Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. 2019;7(427)1-16. (SCI:3.0)
9) Shi Yuchen#; Liu Hui#; Yang Changbo#; Xu Kang#; Cai yangyang; Wang Zhao; Zhao Zheng*;Shao Tingting*; Li Yixue*; Transcriptomic Analyses for Identification and Prioritization of Genes Associated With Alzheimer’s Disease in Humans, Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 2020, 31(8).(SCI:6.604)
10) Juan Xu,Tingting Shao, Na Ding, Yongsheng Li* and Xia Li*, miRNA- miRNA Crosstalk: From Genomics to Phenomics, Briefings in Bioinformatics, 2016, 18:1002-1011.(SCI:13.994)
11) Juan Xu#, Lin Feng#, Zujing Han#, Yongsheng Li#, Aiwei Wu,Tingting Shao, Na Ding, Lili Li, Wei Deng, Xuebing Di, Jian Wang, Lianfeng Zhang, Xia Li*, Kaitai Zhang*, Shujun Cheng*, Extensive ceRNA-ceRNA interaction networks mediated by miRNAs regulate development in multiple rhesus tissues, Nucleic Acids Res, 2016, 44(19):9438.(SCI: 19.160)
12) Yongsheng Li#, Juan Chen#, Jinwen Zhang#, Zishan Wang,Tingting Shao, Chunjie Jiang, Juan Xu*, Xia Li*,Construction and analysis of lncRNA-lncRNA synergistic networks to reveal clinically relevant lncRNAs in cancer, Oncotarget, 2015,6(28): 25003-16.
13) Juan Xu#,Yongsheng Li#,Jianping Lu#,Tao Pan,Na Ding, Zishan Wang,Tingting Shao, Jinwen Zhang, Lihua Wang*,Xia Li*,The mRNA related ceRNA–ceRNA landscape and significance across 20 major cancer types, Nucleic Acids Res, 2015, 43(17): 8169-82.(SCI: 19.160)
14) Yongsheng Li#, Shengli Li#, Juan Chen,Tingting Shao, Chunjie Jiang, Yuan Wang, Hong Chen, Juan Xu*, Xia Li*, Comparative epigenetic analyses reveal distinct patterns of oncogenic pathways activation in breast cancer subtypes, Human Molecular Genetics, 2014, 23(20): 5378-5393.(SCI:5.121)
15) Yongsheng Li#, Juan Xu#, Huanyu Ju#, Yun Xiao, Hong Chen, Junying Lv,Tingting Shao, Jing Bai, Yunpeng Zhang, Li Wang, Xishan Wang*, Huan Ren*, Xia Li*, A network-based, integrative approach to identify genes with aberrant co-methylation in colorectal cancer, Molecular Biosystems, 2014, 10(2):180-190.
16) Jing Bai#, Yongsheng Li#,Tingting Shao, Zheng Zhao, Yuan Wang, Aiwei Wu, Hong Chen, ShengliLi, Chunjie Jiang, Juan Xu*, Xia Li*, Integrating analysis reveals microRNA-mediated pathwaycrosstalk among Crohn's disease, ulcerative colitis and colorectal cancer, MolecularBiosystems, 2014, 10(9): 2317-2328.
17) Xiaoyu Lin§, Tiantongfei Jiang§, Jing Bai§, Junyi Li, Tianshi Wang, Jun Xiao, Yi Tian, Xiyun Jin,Tingting Shao, Juan Xu, Lingchao Chen*, Lihua Wang*, and Yongsheng Li*. Characterization of Transcriptome Transition Associates Long Noncoding RNAs with Glioma Progression[J]. Molecular Therapy: Nucleic Acids ,2018.(SCI: 10.183)
18) Juan Xu§, Yongsheng Li§, Xiang Li§, Chuanxing Li, Tingting Shao, Jing Bai, Hong Chen, Xia Li*.Dissection of the potential characteristic of miRNA-miRNA functional synergistic regulations [J].Mol Biosyst, 2013, 9(2): 217-2